Existen dos programas principales para implementar la financiación basada en incentivos en el sector del agua, saneamiento e higiene en Indonesia. Estos son Water Hibah (una subvención para promover la asignación de una parte del presupuesto de los gobiernos locales al aumento de la conexión de los hogares a los sistemas de abastecimiento de agua corriente en zonas rurales y urbanas) y Sanitation Hibah (una subvención para promover la asignación de una parte del presupuesto de los gobiernos locales al incremento del acceso a un mejor saneamiento; por ejemplo, optimizando las conexiones de los hogares con los sistemas de alcantarillado existentes a escala urbana, desarrollando nuevos sistemas de alcantarillado descentralizados y mejorando los tanques sépticos en los hogares). El Ministerio de Planificación Nacional y Desarrollo y el Ministerio de Obras Públicas y Vivienda se encargan de coordinar el programa. Este último Ministerio también ejerce de organismo general de ejecución del programa, con la asistencia del Ministerio de Finanzas y el apoyo del Departamento de Relaciones Exteriores y Comercio de Australia. Los fondos para los gobiernos locales se transfieren directamente desde el Ministerio de Finanzas.